Как и когда перечислить недоимку по НДФЛ, которая не отражена в 6-НДФЛ?

Добрый день. Уважаемые форумчане просьба помочь в следующей ситуации: У сотрудника в июне месяце был превышен лимит по предоставлению стандартного налогового вычета. Это я обнаружила только сейчас. Соответственно был недоплачен НДФЛ за июнь и переплата по з/п за июнь ( программа начислила з/а за июнь учитывая налоговый вычет). Так же уже сдан 6-НДФЛ за полугодие 2017г.  Сегодня я перечислила недоплату по НДФЛ и з/п с учетом переплаты за июнь. Подскажите пожалуйста  будут ли какие то санкции за недоплату. И как поступить с 6-НДФЛ сдавать корректировку? Или  можно показать это в отчете за 3-й кв?